STT Kristus Alfa Omega (STT KAO) adalah pengembangan dari Sekolah Alkitab Kristus Alfa Omega (SALOM), yang didirikan oleh Pdt. Ir. Timotius Subekti melalui Yayasan Suara Agape pada tanggal 29 Agustus 1991. (Tanggal 29 Agustus tersebut kemudian ditetapkan sebagai hari jadi STT KAO hingga saat ini)

Keberadaan STT KAO tidak lepas dari keberadaan Gereja Beth-El Tabernakel Kristus Alfa Omega (GBT KAO) Semarang, yang merupakan pendiri dan pemilik STT Kristus Alfa Omega. Bapak Pdt. Ir. Timotius Subekti, yang adalah Gembala Sidang GBT Kristus Alfa Omega Semarang, sejak semula memiliki visi yang jelas dari Tuhan untuk membina dan memperlengkapi para pemuda Kristen yang terpanggil menjadi hamba Tuhan, dan menjadi perintis jemaat (church planter) guna memperluas kerajaan Allah di muka bumi ini. Pendirian STT KAO merupakan salah satu bentuk perwujudan dari visi tersebut

Pada tahun 1991 ada 11 orang anggota jemaat GBT KAO Semarang, yang rindu menyerahkan diri menjadi hamba Tuhan dan diperlengkapi secara khusus di sekolah Alkitab secara bersama- sama. Hal ini mendorong Bapak Pdt. Ir. Timotius Subekti untuk lebih mempercepat pembukaan Sekolah Alkitab yang sudah lama ada di dalam visi beliau

Pada tahun 1991, perkuliahan Sekolah Alkitab Kristus Alfa Omega mulai dibuka dan dilaksanakan, dengan tempat penyelenggaraan awal di Jl. Seteran Selatan Nomor 53 Semarang. Gedung perkuliahan yang digunakan pada waktu itu adalah gedung Gereja GBT Kristus Alfa Omega lama yang ada di Jl. Seteran. Pada awal pembukaannya, program yang dibukaadalah dengan konsentrasi utama pembelajaran adalah Perintisan Jemaat. Dengan fasilitas yang serba sederhana perkuliahan terus berjalan,

Selanjutnya pada tahun 1991, GBT Kristus Alfa Omega membeli tanah seluas 2.400 M2 di daerah Puri Anjasmoro Semarang, dan mulai melakukan pembangunan kampus, tahap pertama yaitu: pembangunan kelas-kelas. Pada tahun 1992, lokasi kampus dipindahkan ke Jl. Puri Anjasmoro blok J-1 nomor 10A, sejak saat itu pelaksanaan perkuliahan dilakukan di kampus Puri Anjasmoro Semarang

Pada tahun 1993, Sekolah Alkitab Kristus Alfa Omega (SALOM) membangun Gedung Chapel, di lokasi kampus Puri Anjasmoro, yang kemudian diresmikan pada bulan Oktober 1993. Dalam perkembangannya ternyata Gedung Chapel ini sendiri memiliki sejarah yang sangat unik, karena rupanya komunitas sel yang dilaksanakan di Chapel Puri yang dipimpin oleh Bapak Pdt. Soendoro Jahja, di kemudian hari menjadi embrio lahirnya GBT Kristus Alfa Omega yang ada di Puri Anjasmoro

Dalam rangka peningkatan, dan juga atas dorongan dari Dirjen Bimas Kristen (Protestan) Departemen Agama Republik Indonesia di Jakarta, maka pada tahun 1993, Yayasan Suara Agape mendirikan Akademi Alkitab Kristus Alfa Omega (AKA SALOM) dengan Program Diploma dua (D2) konsentrasi Perintisan Jemaat

Pada tahun 1994 GBT Kristus Alfa Omega membeli tanah seluas 600 M2. Pada tahun yang sama pembanguan asrama mahasiswa dilaksanakan dan dapat selesai pada tahun 1995, yang kemudian diresmikan sebagai kampus AKA SALOM. Dengan demikian sejak tahun 1995 seluruh mahasiswa sudah bisa menempati gedung asrama tersebut

Dengan adanya kebutuhan pelayanan gereja di bidang musik, maka pada tahun 2003 dibukalah Program Diploma dua (D2) Musik Gerejawi. Faktor lain yang juga menjadi pendorong dibukanya program ini adalah adanya Sumber Daya Manusia (SDM) yang mumpuni dalam bidang musik, yang baru saja menyelesaikan studi musiknya di Sydney Australia, yaitu Ibu Milka Subekti dan juga SDM lain di GBT KAO yang siap membekali para pemuda Kristen yang rindu melayani di dalam bidang musik gereja

Pada tahun 2003, dimulailah perkuliahan Musik Gerejawi untuk program Diploma Dua. Rupanya mahasiswa Program Diploma Musik Gereja ini sangat diminati oleh gereja-gereja, baik di sekitar Semarang, pulau Jawa maupun luar pulau Jawa. Hal ini nampak dari banyaknya permintaan terhadap pelayanan mahasiswa di Program Studi Musik Gerejawi ini.  Dengan adanya perkembangan yang begitu cepat di segala bidang dan tantangan dunia pelayanan yang semakin kompleks, maka direncanakan dan diusahakan untuk peningkatan AKA SALOM menjadi Sekolah Tinggi Teologi Kristus Alfa Omega (STT KAO)

Pada tahun 2005, itu juga STT Kristus Alfa Omega mendapatkan status Terdaftar berdasarkan Surat Keputusan Dirjen Bimas Kristen Depag RI NO: DJ.III/Kep/HK.00.5/274/2639/2005 tentang Pemberian Status Terdaftar Program Studi (S1) Jurusan Teologi/Kependetaan

Sebagai Anggaran Dasar yang menjadi acuan dalam pengelolaan dan penyelenggaraan Tridarma Perguruan Tinggi, STT Kristus Alfa Omega menetapkan Statuta. Stututa ini juga telah disahkan oleh Dirjen Bimas Kristen Republik Indonesia. Statuta ini berperan penting, yaitu menjadi pedoman dalam merencanakan dan mengembangkan STT Kristus Alfa Omega

Pada tahun 2010 Prodi S1 Teologi Kependetaan mendapatkan Ijin Penyelenggaraan berdasarkan SK Dirjen Bimas Kristen Kemenag RI NO: DJ.III/Kep/HK.00.5/508/2010. Kemudian pada tahun yang sama 2010 Prodi S1 Pendidikan Agama Kristen juga mendapatkan Ijin Penyelenggaraan berdasarkan SK Dirjen Bimas Kristen Kemenag RI NO: DJ.III/Kep/HK.00.5/533/2010. SK Ijin Penyelenggaraan tersebut kemudian diperbaharui dengan Perpanjangan Ijin Penyelenggaraan berdasarkan SK Dirjen Bimas Kristen Kemenag RI NO: DJ.III/Kep/HK.00.5/801/2011 untuk Prodi Teologi dan SK Dirjen Bimas Kristen Kemenag RI NO: DJ.III/Kep/HK.00.5/801/2011 untuk Prodi PAK

Puji Tuhan, di awal tahun 2013 tepatnya pada tanggal 14 Februari 2013, STT Kristus Alfa Omega telah dinyatakan terakreditasi Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT), berdasarkan SK nomor: 051/SK/BAN-PT/AK-XV/S/II/2013

Pada tahun 2013 itu juga, STT Kristus Alfa Omega mengajukan pembukaan 2 (dua) Prodi baru, yaitu Prodi S1 Musik Gerejawi dan MA bidang Misi ke Dirjen Bimas Kristen RI. Prodi S1 Musik Gerejawi yang dibuka adalah merupakan pengembangan dari Prodi Diploma Dua Musik Gerejawi yang sudah berjalan selama 10 tahun. Pada bulan Mei 2013, atas anugerah-Nya kedua Prodi ini (S1 Musik Gerejawi dan MA bidang Misi) mendapatkan ijin operasional dari Dirjen Bimas Kristen Republik Indonesia. Oleh karena itu pada tahun ajaran 2013/2014 kedua Prodi tersebut mulai dilaksanakan

Sebenarnya STT Kristus Alfa Omega sejak tahun 1992 telah memiliki gedung kampus sendiri yang terletak di Jl. Puri Anjasmoro J1/10A Semarang dengan luas kurang lebih 3.000 M2. Tetapi, karena adanya kebutuhan yang semakin meningkat dan juga untuk meningkatkan mutu STT Kristus Alfa Omega yang harus ditunjang dengan sarana dan prasarana yang memadai, maka Yayasan Pendidikan Kristen Kristus Alfa Omega bermaksud untuk memindahkan kampus yang ada ke tempat yang lebih representatif untuk kampus STT Kristus Alfa Omega.  Pada tahun 2007, Yayasan Pendidikan Kristus Alfa Omega (YP-KAO) telah membeli lahan untuk pembangunan kampus dengan luas tanah kurang lebih 2 Ha2 di daerah Tuntang Salatiga. Pembangunan kampus yang diharapkan dapat selesai pada tahun 2010, ternyata tidak dapat berjalan sebagaimana yang diharapkan, karena mengalami hambatan dari luar. Hal tersebut membuat yayasan harus mencari lahan lain

Pada bulan Agustus 2011, yayasan membeli tanah di wilayah Perumahan Bukit Semarang Baru (BSB) dengan luas lahan seluas kurang lebih 7.031 M2, di atas lahan tersebut kampus STT Kristus Alfa Omega dibangun dan telah diresmikan pada tanggal 26 Agustus 2013 Sebelumnya, sementara menunggu pembangunan kampus STT Kristus Alfa Omega di BSB selesai, dari awal tahun 2012 yayasan mendapat pinjaman gedung yang terletak di Perumahan Ketileng Jl. Ketileng Indah Raya No. 3, Semarang. Mengingat pembangunan kampus STT Kristus Alfa Omega sudah memasuki tahap finishing, maka sesuai rencana pada akhir Juni 2013 dilakukan pemindahan kampus dari Ketileng ke kampus baru di BSB Semarang. Sehingga perkuliahan semester ganjil tahun ajaran 2013/2014 bisa dilaksanakan di kampus baru BSB, Semarang. Berkenaan dengan perubahan fokus pelayanan dari Yayasan Suara Agape, maka penyelenggaraan STT Kristus Alfa Omega dilimpahkan kepada Yayasan Pendidikan Kristen Kristus Alfa Omega sampai sekarang

Demikianlah kampus STT KAO sekarang berdiri dan beralamat di Kawasan Pendidikan dan Sosial Blok E No. 1 Perumahan BSB City, Kel. Jatibarang, Kec. Mijen, Semarang, Jawa Tengah, Indonesia