Salah satu bentuk layanan STT Kristus Alfa Omega kepada mahasiswa adalah beasiswa Prestasi. Beasiswa jenis ini diperuntukkan bagi mahasiswa Regular STT KAO yang memiliki nilai Indeks Prestasi terbaik di program studi masing-masing. Bagi mahasiswa yang mendapatkan beasiswa prestasi ini, mereka akan mendapatkan keringanan biaya pendidikan untuk semester yang akan datang.
Selain menyediakan layanan beasiswa Prestasi, STT Kristus Alfa Omega juga menyediakan beasiswa ikatan dinas. Adapun yang dimaksud dengan beasiswa ini adalah beasiswa yang disediakan khusus bagi mahasiswa yang terpanggil untuk pelayanan Church Planting dengan memenuhi persyaratan dan bersedia menjalankan masa ikatan dinas setelah selesai kuliah. Adapun beasiswa ini mencakup sumbangan perdana, sumbangan pengembangan pendidikan (SPP), biaya SKS, dan juga biaya Asrama dan makan.
Beasiswa ikatan dinas ini diberikan mulai dari Tingkat